מכללת באקה היא מוסד חינוכי השואף למשוך אליו סטודנטים מרקעים חברתיים-כלכליים מגוונים בחברה הישראלית בכלל ובחברה הערבית בפרט. המכללה תעודד את תלמידיה ותאפשר להם לממש את יכולותיהם הפוטנציאליות. בנוסף, תשקיע המכללה מאמצים רבים בפיתוח סגל ההוראה ובהעצמת העשייה המחקרית.

ייחודה של המכללה טמון ביכולתה ליצור שותפויות וקשרים הדדיים בין חברה מתפתחת בעלת מאפיינים שמרניים לבין תפיסות חינוכיות וגישות ניהוליות מתקדמות. המכללה מובילה מגמה של קידום נשים בחברה הערבית – כסטודנטיות, מרצות, חוקרות, ובעלות תפקידים בכירים בתחומים האקדמיים והניהוליים. מכאן פועלת המכללה לפיתוח ההון האנושי, על בסיס חירות הבחירה, זכויות האדם וזכויות האישה, כחלק מחברה מתקדמת.

מכללת באקה הוקמה במטרה לאפשר נגישות להשכלה גבוהה עבור החברה הערבית בישראל, בהתאם ליעדים המרכזיים של המועצה להשכלה גבוהה. המכללה מציעה תוכניות לימוד שיש להן הדהוד משמעותי בשוק העבודה, ומסייעת לבוגריה להשתלב בו בהצלחה.

המכללה שואפת להעלות את שיעור הבוגרים הערבים מתוכניותיה האקדמיות – יעד שיאפשר לחברה הערבית להשתלב בכלכלה הלאומית ולתרום לה. זאת, נוכח הנתון הכלכלי המדאיג לפיו המשק בישראל מפסיד מדי שנה כ-40 מיליארד ש"ח בתוצר הלאומי הגולמי בשל מיצוי חלקי של הפוטנציאל בחברה הערבית. לכן, המכללה תיתן מענה לצרכים הלימודיים-חברתיים של הסטודנטים הערבים, ותעניק להם סביבה תומכת שתסייע להם לממש את כישוריהם האקדמיים ולהוציאם אל הפועל. מתוך כך, תפעל המכללה לצמצום תופעת הלימודים האקדמיים בחו"ל, שהולכת ומתרחבת, על ידי התאמה לצרכי הסטודנטים במוסדנו.

המכללה תתמקד בקידום מושג היזמות, בשל עיסוקה במחקר טכנולוגי וארגוני-כלכלי – דבר שיתרום לפיתוח הכלכלה בחברה הערבית, יסייע בהרחבת מעמד הביניים, וישפר את איכות החיים ורמתה. תוצאה מכך תהיה הפחתת תחושת ההדרה בקרב בני החברה הערבית, תחושה שנובעת מהזנחה ואי-שוויון. כל אלו מחייבים חממה ידעית שתפתח כישורים ותספק כלים אקדמיים לסטודנטים – מציאות שמכללת באקה, "מכללה ערבית שמחברת בינינו", שואפת להוביל.